Narodil sa 3. októbra 1936 vo východočeských Holicích. Po tom, ako v roku 1938 skrachovala ich rodinná továreň na výrobu obuvi, spáchal jeho otec samovraždu.
Pre divadlo sa prvýkrát nadchol už na keramickej škole v Bechyni. V rokoch 1954 až 1960 študoval réžiu na pražskej DAMU.
Pred kamerou debutoval v roku 1959 v snímke Probuzení, kde stvárnil relatívne malú úlohu.
Ako režisér pôsobil v Divadle ABC a neskôr v Divadle Petra Bezruče, Vinohradskom divadle a Národnom divadle. V roku 1978 režíroval film Město mé naděje.
Prečítajte si náš posledný rozhovor s Janom Kačerom.
Čítajte viac Legendárny herec Jan Kačer: Prečo by som mal byť starý, keď nemusím?V roku 1963 stvárnil hlavnú úlohu zraneného partizána vo vojnovej dráme Smrt si říká Engelchen. Ďalej účinkoval vo filmoch ako Cesta hlubokým lesem, Každý den odvahu, Nikdo se nebude smát, Den sedmý, Osmá noc či Údolí včel. Jeho posledným filmom bola Moc režiséra Mátyása Priklera.
Zahral si tiež v seriáloch Jana Eyrová, Rodinná pouta a Velmi křehké vztahy.
V rokoch 1990 až 1992 bol poslancom Federálneho zhromaždenia.
Jeho manželkou bola herečka Nina Divíšková, s ktorou mal tri dcéry.