Hlavnú cenu Trilobit si odniesli scenárista Štěpán Hulík a režiséri Ivan Zachariáš a Alice Nellis za seriál Pustina (2016). Okrem nich dostali Trilobitov tiež Vitalij Manskij, Vít Klusák a Filip Remunda za dokument V lúčoch slnka (2015) a Pavel Štingl za dokument Odvaha (2016).
Zvláštnu cenu poroty, ktorá vyberala celkovo z 90 audiovizuálnych diel, dostali Rozálie Kohoutová a Tomáš Bojar za dokument FC Roma (2016). Cenu Josefa Škvoreckého za adaptáciu literárneho diela udelili Tereze Kovářovej za snímku ZOO (2016), Cenu Vladislava Vančuru za prínos kinematografie získal Jaromír Šofr za celoživotné dielo a Cenu detstkej poroty – Berounský Medvídek dostal animovaný film Lichožrúti (2016) Galiny Miklínovej.